水污染会影响人体健康和生命安全，外界水环境污染造成人体内环境的污染。
《中国居民饮水指南》指出，介水性疾病包括4个方面，介水传染病、化学污染引起的疾病、与饮用水有关的生物地球化学性疾病及藻类污染引起的疾病。
1、介水性传染病
介水性传染病是通过饮用或接触受病原体污染的水而传播的疾病，又称水性传染病。其中，通过饮用水途径传播的主要为介水性肠道传染病，其主要原因是水源水受到病原体污染后，没有得到有效的消毒处理，饮水设备或输配管道被污染，被消费者饮用后，引发大面积的疾病暴发。介水性传染病一旦暴发，危害较大，短期内出现大量的患者。霍乱就是经水传播的传染病之一。
2、化学污染引起的疾病
据世界卫生组织资料显示，现查明全世界水体中有种化学物质，其中饮用水中有害的有机污染物种。这些化学物质在水中残留时间长，多数不易被降解，可直接对人体产生毒害作用，高浓度短时间作用于人体可产生急性毒性作用；低浓度长时间作用于人体可产生慢性毒性作用，甚至引起公害病。如上世纪中期在日本发生的水俣病。
而且现代科学已经有力证明，饮水与癌症发病率之间的确存在着某些因果关系。世界卫生组织调查表明，目前从饮用水中检出的种有害有机物中，确认致癌物有20种。其中一些化学污染物还是环境内分泌干扰物，它能改变人机体内分泌功能，并对机体及其后代引起有害效应。
*事医学科学院卫生学环境医学研究所李君文教授在接受媒体采访时表示，由饮水不洁而引起的疾病很多，如重金属污染之后引起肝、肾等功能的损害等。
3、与饮用水有关的生物地球化学性疾病
我国常见的有地方性氟中毒、地方性砷中毒和地方性甲状腺肿等。
人体从水摄入过量的氟会引起一种慢性的全身性疾病。主要表现为氟斑牙和氟骨症。氟斑牙主要表现为门牙出现釉斑，牙齿表面粗糙无光泽，严重时牙面磨损，碎裂并脱落。氟骨症主要表现为四肢、脊柱关节持续疼痛，关节僵硬，骨骼变形，甚至瘫痪。
地方性砷中毒是由于饮用含砷量高的水而引起的一种地方病。主要表现为末梢神经炎，皮肤色素沉着，手掌和脚掌皮肤高度角化，严重者可致皮肤癌。由于砷进入机体后引起四肢（尤其是下肢）血管神经紊乱，使肢体血管痉挛，最后完全阻塞，导致皮肤变黑坏死，因此该病又称黑脚病。
4、藻类污染引起的疾病
近年来，受有机污染的水体富营养化的危害日趋严重。在富营养化水体中藻类大量繁殖聚集，浮于水面可影响水的感官性状，使水质异臭异味。
我国富营养化淡水湖泊中的蓝藻是主要的产毒门类，已知的产毒种属有40多种，其中铜绿微囊藻产生的微囊藻毒素和泡沫节球产生的节球藻毒素是富营养化水体中含量最多、对人体危害最大的两类毒素。藻类毒素一旦进入饮水中，一般的供水净化处理和家庭煮沸均不能使之彻底去除，所以藻类毒素已受到人们的高度重视。
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